Metelių regioninio parko augmenijos ir gyvūnijos savitumus nulėmė geografinė padėtis, savitas klimatas ir unikalus reljefas. Parke iki šiol užregistruota 1676 augalų ir gyvūnų rūšys. Čia prieglobstį randa 113 Lietuvos RK (Raudonosios knygos) augalų ir gyvūnų rūšys. Trako miške, vienintelėje vietoje visoje šalyje, auga bekočių ąžuolų miškas. Šis medis vienintelis įrašytas į Lietuvos Raudonąją knygą. Netoli už šio miško, Juodabalės herpetologiniame draustinyje, karaliauja nykstantys baliniai vėžliai, kurių čia suskaičiuojama apie 36. Obelytės gamtiniame rezervate puikuojasi etaloniniai Lietuvoje liepiniai skroblynai, o Širvinto miške – ąžuolai, perkopę 300 metų slenkstį. Du iš jų paskelbti gamtos paminklais.